Pigbase: jádro našeho šlechtitelského programu
Je považována za největší databázi chovných prasat svého druhu na světě. Pigbase je jedinečná a je jádrem šlechtitelského programu Topigs Norsvin. Pigbase ukládá informace o 45 milionech prasat.
Pigbase obsahuje nejen fenotypová data shromážděná na nukleových farmách. Obsahuje také mnoho údajů z komerčních farem, které pracují s InGene, šlechtitelským programem pro uzavřené chovy, nebo jsou zapojeny do programu CCPS (Kombinovaná selekce kříženců a čistokrevných jedinců). To z ní činí jedinečnou databázi svého druhu. Kromě toho jsou v Pigbase uložena a používána data z CT skenování prováděného na stanicích Delta, z inseminačních stanic, jatek a data z výzkumných projektů.
Program genotypizace Topigs Norsvin se v posledních letech rychle rozšířil. S rozvojem genomické selekce a dalších DNA technologií je k dispozici více údajů, které lze použít při výpočtu plemenných hodnot, tvorbě selekčních listin a dalších.
Obrovské množství dat a řádně fungující databáze nejsou jediné věci potřebné pro dokonalý šlechtitelský program. Pro dosažení genetického pokroku je důležitá kvalita dat. Kontrola kvality je organizována kombinací dobře proškolených a dobře informovaných lidí pracujících uvnitř nukleových farem a jasných protokolů, které jsou podporovány databází Pigbase. Pigbase obsahuje automatickou kontrolu kvality dat pomocí počítačových algoritmů a upozorňuje IT odborníky, kteří mohou podniknout odpovídající kroky v případě chyb nebo problémů.
Fakta o Pigbase:
- Data o 45 milionech prasat
- Přidává se kolem 2,5 milionu prasat ročně
- Téměř 1 000 šlechtitelských farem ve 40 zemích
- Více než 37 milionů obrázků z CT skenování
- DNA více než 1,2 milionů prasat
- Genotypizováno více než 400 000 prasat
- Uloženo více než 20 miliard SNP
- Uložiště o velikosti 100 TB
- Vypočítává se 2,6 miliard plemenných hodnot/den = 30 000 výpočtů/sekundu